Medicin mod depression kaldes antidepressiva, den bruges primært til behandling af en aktuel depression eller til forebyggende behandling mod tilbagevendende depressive tilstande. Den biologiske forklaring på depression er, at der er for lidt transmitterstof (budbringerstof) mellem nogle af hjernens celler og det giver depression. Det har endnu ikke været muligt at bevise denne model videnskabeligt. Stofferne (antidepressiva) øger transmitterfunktionen, og det tages som et indirekte bevis for, at teorien passer.

Antidepressiva nedbrydes i leveren, og der er en stor forskel fra person til person, hvor hurtigt det sker, derfor er doseringen meget individuel. Med fordel kan man udfra blodprøver bestemme den mest hensigtsmæssige dosering, således at risikoen for bivirkninger bliver så lille som muligt.
Antidepressiva eksisterer kun som tabletter (de forefindes ikke så de kan gives som injektion).

Behandling af depression ved uni- og bipolæretilstande.
Den medicinske behandling af de to typer af depression er i stabiliseringsfasen, langtidsbehandlingen og forebyggelsesbehandling mod tilbagefald forskellig.
• unipolar depression skal behandles med et antidepressiva evt. supleret med Lithium
• depression på baggrund af en bipolar tilstand (maniodepression) behandles bedst med et atypisk antipsykotika eller Lithium.