LSD og de andre kemisk fremstillede stoffer, som påvirker vores sanseoplevelser og stemninger, er kun i mindre grad skadelige for kroppen. Store doser kan medføre forgiftninger, som kan være dødelige. Der er derimod ikke med sikkerhed beskrevet organskader, men vor viden er ikke særlig stor.

De dødsfald, som er beskrevet i forbindelse med indtagelse af ecstacy, hænger formentlig i høj grad sammen med hyperaktivitet og dehydrering fremfor en direkte giftvirkning fra stoffet.

Man har set meget alvorlige hjerneskader efter indtagelse af forurenede designerdrugs. Nogle har udviklet Parkinsons sygdom, som er så kraftig, at patienten er fuldstændig ude af stand til at bevæge sig, som man kan se ved vidt fremskreden parkinsonisme. Man har i den forbindelse talt om "frosne mennesker".

Der kan ved indtagelse af større doser af fx LSD optræde en psykose. Da stofferne indtages for at fremkalde psykoselignende tilstande, kan man diskutere, om der er tale om en bivirkning eller en særlig kraftig virkning. Under alle omstændigheder kan det være meget angstfremkaldende og på anden måde farligt at befinde sig i en sindssygelig tilstand, hvor man ikke har fuld kontrol over, hvad man gør. Psykosen går over af sig selv, men forløbet kan forkortes ved anvendelse af antipsykosemedicin.